Nonlinear Physics of DNA
Wiley-VCH (Verlag)
978-3-527-40417-9 (ISBN)
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Das dynamische Verhalten von DNA-Molekülen wirklich zu verstehen, gehört heute zu den großen Herausforderungen der Grundlagenforschung in der Biochemie und Molekularbiologie. Früher und oft auch noch heute wurden dabei lineare mathematische Modelle verwendet; dabei hat sich in den letzten Jahren immer deutlicher gezeigt, dass erst eine Berücksichtigung nichtlinearer Effekte eine wirklichkeitsgetreue Beschreibung ermöglicht.Diese Modelle werden hier erstmals umfassend und detailliert beschrieben. Die vorliegende zweite Auflage wurde dabei völlig überarbeitet und deutlich erweitert, um den aktuellsten Resultaten Rechnung zu tragen.Nach einführenden Kapiteln zu Struktur und Dynamik der DNA vergleicht die Autorin lineare und nichtlineare mathematische Modelle und beschreibt die nichtlineare Dynamik der DNA. Anschließend zeigt sie an praktischen Beispielen, welchen Effekt die Verwendung nichtlinearer Modelle auf die Auswertung experimenteller Daten hat.Diese zweite Auflage ist ein essentielles Werkzeug für alle, die sich mit Struktur und Dynamik von DNA oder anderen großen Biomolekülen befassen.
Ludmila V. Yakushevich is a Doctor of Science and leading research worker of the Laboratory of Physical and Chemical Mechanisms of Gene Expression, which is part of the Institute of Cell Biophysics of the Russian Academy of Sciences. The main research field is the dynamics of biopolymers, especially the nonlinear dynamics of DNA. The principal methods of investigations include theoretical physics and mathematical modeling.
CHAPTER 1 DNA STRUCTURE
1.1 Chemical composition and primary structure
1.2 Spatial geometry and secondary structure
1.3 Forces stabilizing secondary structure
1.4 Polymorphism
1.5 Tertiary structure
1.6 Approximate models of DNA structure
1.7 Experimental methods of studying DNA structure
CHAPTER 2 DNA DYNAMICS
2.1 General picture of the internal mobility
2.2 Twisting and bending motions
2.3 Dynamics of bases
2.4 Dynamics of sugar-phosphate backbone
2.5 Conformational transitions
2.6 Motions associated with local strand separation
2.7 Approximate models of DNA dynamics
2.8 Experimental methods of studying DNA dynamics
CHAPTER 3 DNA FUNCTIONING
3.1 Physical aspects of DNA functioning
3.2 Intercalation
3.3 DNA-protein recognition
3.4 Gene expression
3.5 Regulation of gene expression
3.6 Replication
CHAPTER 4 LINEAR THEORY OF DNA
4.1 The main mathematical models
4.2 Statistics of linear excitations
4.3 Scattering problem
4.4 Linear theory and experiment
CHAPTER 5 NONLINEAR THEORY OF DNA: IDEAL DYNAMICAL MODELS
5.1 Nonlinear mathematical modeling: general principles and restrictions
5.2 Nonlinear rod-like models
5.3 Nonlinear double rod-like models
5.4 Nonlinear models of higher levels
CHAPTER 6 NONLINEAR THEORY OF DNA: NON-IDEAL MODELS
6.1 Effects of environment
6.2 Effects of inhomogeneity
| Erscheint lt. Verlag | 11.5.2004 |
|---|---|
| Sprache | englisch |
| Maße | 170 x 240 mm |
| Gewicht | 530 g |
| Themenwelt | Naturwissenschaften ► Biologie ► Genetik / Molekularbiologie |
| Naturwissenschaften ► Physik / Astronomie | |
| Schlagworte | Biochemie u. Chemische Biologie • Biochemistry (Chemical Biology) • Biopolymere • biopolymers • Biowissenschaften • Cell & Molecular Biology • Cell & Molecular Biology • Chemie • Chemistry • Computational Chemistry & Molecular Modeling • Computational Chemistry & Molecular Modeling • Computational Chemistry u. Molecular Modeling • DNS • DNS (Desoxyribonukleinsäure) • Life Sciences • Life Sciences Special Topics • Mathematical & Computational Physics • Mathematical & Computational Physics • Mathematische Physik • Nichtlineare Physik • Nichtlineare u. komplexe Systeme • Nonlinear and Complex Systems • Physics • Physik • Polymer Science & Technology • Polymer Science & Technology • Polymerwissenschaft u. -technologie • Spezialthemen Biowissenschaften • Zell- u. Molekularbiologie |
| ISBN-10 | 3-527-40417-1 / 3527404171 |
| ISBN-13 | 978-3-527-40417-9 / 9783527404179 |
| Zustand | Neuware |
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