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Genome Analysis in R
Seiten
2021
Apple Academic Press Inc. (Verlag)
978-1-4822-1036-1 (ISBN)
Apple Academic Press Inc. (Verlag)
978-1-4822-1036-1 (ISBN)
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In recent years the amount of biological sequence data available for research has increased significantly and complete genome sequences have become commonplace. Next-generation sequencing (NGS) is expected to revolutionize biomedical research. However, the analysis of millions of DNA/RNA sequences is becoming a real challenge as the capabilities of standard computers have been far exceeded. This book guides readers in the processing and analyzing of genome-wide data with minimum computer RAM requirements. It focuses on practical solutions to a wide range of next-generation sequencing bioinformatic problems such as data import, read demultiplexing, trimming, quality checks, alignment, transformations, normalization, annotation, motif search, and differential expression. No prior programming knowledge is required.
Preface. Introduction to Genome Biology. R Essentials. Bioconductor Bioinformatics Packages. Sequence Manipulations. Parsing Genomic Features. Next Gen Sequence Processing. Working with Genomic Databases. Motif Discovery Packages. Genome Methylation Analysis. Transcriptome Analysis (RNA-seq). Case studies.
Erscheint lt. Verlag | 1.1.2021 |
---|---|
Reihe/Serie | Chapman & Hall/CRC Mathematical and Computational Biology |
Verlagsort | Oakville |
Sprache | englisch |
Maße | 156 x 234 mm |
Themenwelt | Informatik ► Weitere Themen ► Bioinformatik |
Mathematik / Informatik ► Mathematik ► Computerprogramme / Computeralgebra | |
Naturwissenschaften ► Biologie ► Genetik / Molekularbiologie | |
ISBN-10 | 1-4822-1036-3 / 1482210363 |
ISBN-13 | 978-1-4822-1036-1 / 9781482210361 |
Zustand | Neuware |
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