Le Logiciel R

Pierre Lafaye de Micheaux est un chercheur canadien, francais et suisse. Apres une Licence en physique et un Master en biostatistique, il a obtenu en 2003 un Ph.D. en statistique mathematique decerne conjointement par l'Universite Montpellier 2 (France) et l'Universite de Montreal (Canada). Apres deux post-doc au Centre de Recherche Mathematique de Montreal puis au McConnell Brain Imaging Centre du Montreal Neurological Institute de l'Universite McGill, il a obtenu un poste de Maitre de Conferences a l'Universite de Grenoble. En 2007, il obtient un diplome de Master en Neurosciences Cognitives de l'Institut National Polytechnique de Grenoble et la meme annee, il integre le Grenoble Institute of Neuroscience comme chercheur associe. En 2009, il rejoint le Departement de Mathematiques et Statistique de l'Universite de Montreal, ou il est promu Professeur agrege deux ans plus tard. En 2013 2014, il est Senior Visiting Fellow a la School of Mathematics and Statistics, ainsi qu'au Centre for Healthy Brain Ageing de l'Universite de New South Wales en Australie. Il est l'auteur de nombreuses publications dans des revues internationales en statistique ou neuroscience et a presente ses travaux dans plusieurs conferences. Ses interets de recherche incluent la theorie asymptotique, la biostatistique, le bootstrap, les champs aleatoires complexes, le developpement de packages R, les test d'hypotheses, l'Analyse en Composantes Independantes, les methodes de regression lineaire, la selection de modeles, la multiplicite des tests, la statistique multivariee, les neurosciences, la recherche reproductible, la determination de taille echantillonnale, les processus stochastiques, la didactique et les series chronologiques. C'est un utilisateur experimente de Linux et de R depuis 1998 et le co-auteur de plusieurs packages R disponibles sur le CRAN. Remy Drouilhet, ne en 1965, est un chercheur francais, originaire de la ville de Pau dans les Pyrenees Atlantiques. Apres un doctorat en mathematiques appliquees, option statistique (autour du comportement spectral du mouvement Brownien fractionnaire) obtenu en 1993 a l'Universite de Pau et des Pays de l'Adour puis un post-doc a - Rice University - a Houston (Texas) au deuxieme semestre 1994, il est recrute en 1995 a l'universite Pierre Mendes-France de Grenoble en tant que Maitre de conferences en faculte d'economie. Ses principales thematiques de recherches sont existence, unicite et percolation dans le cadre des processus ponctuels spatiaux bases sur des interactions de type plus-proches voisins. Actuellement dans l'equipe FIGAL du laboratoire LJK a Grenoble, il s'interesse aussi a la fiabilite. A la fois dans ses activites d'enseignement et de recherche, il est un utilisateur-developpeur experimente du logiciel R depuis la premiere heure. En tant que fervent supporter du Logiciel Libre, il aime initier son entourage a l'utilisation du logiciel R. Benoit Liquet, ne en 1975, est un enseignant-chercheur francais originaire de la petite ville de Creon en Gironde. Il suit des etudes universitaires en mathematiques appliquees a l universite de Bordeaux 1, se tourne ensuite vers la statistique et obtient en 2002 un doctorat en Biostatistique a l universite de Bordeaux Segalen. Il poursuit ses recherches sur la selection de modeles avec des applications biomedicales a l Universite de Montpellier 2 ou il s interesse aux methodes de reduction de la dimension. Nomme en 2004 maitre de conferences a l universite de Grenoble, et rattache au Laboratoire Jean Kuntzman, il enseigne pendant trois ans au sein de l'IUT de statistique et informatique decisionnelle. En 2007, Il obtient une mutation professionnelle a l Universite Bordeaux Segalen et effectue sa recherche au sein de l equipe Biostatistique de l INSERM U897. Il effectue ses enseignements a l Institut de Sante Publique d Epidemiologie et de Developpement ou il impulse l usage du logiciel R. Recemment, il developpe un vif interet pour l analyse de donnees genomiques issues d essais vaccinaux contre le VIH. En 2011, il obtient un conge pour recherche et conversion thematique qui lui permet d integrer une equipe de bio-informatique de l universite de Queensland a Brisbane et de se consacrer pleinement a la statistique genomique. Il integre en 2012 l'equipe Biostatistique du MRC (Medical Research Council) a Cambridge ou il collabore avec Sylvia Richarson autour des methodes de selection bayesiennes pour des donnees de grand dimension. Il poursuit actuellement ces activites de recherche et d'enseignement a l'Universite de Queensland a Brisbane en tant que Senior Lecturer. Il est l'auteur de plusieurs publications scientifiques dans des journaux internationaux en statistique, et de plusieurs greffons R."

Présentation du logiciel R.- Quelques jeux de données et problématiques.- Les concepts de base, l’organisation des données.- Importation-exportation et production de données.- Manipulation de données, fonctions.- R et sa documentation.- Techniques pour tracer des courbes et des graphiques.- Programmation en R.- Maintenance des sessions.- Mathématiques et statistiques élémentaires.- Mathématiques de base : calcul matriciel, intégration, optimisation.- Statistique descriptive.- Variables aléatoires, lois et simulations : une meilleure compréhension grâce aux spécificités de R.- Intervalles de confiance et tests d’hypothèses.- Régression linéaire simple et multiple.- Analyse de variance élémentaire.- Annexes : Installation du logiciel R et des packages R.