Sequence Alignment (eBook)
360 Seiten
University of California Press (Verlag)
978-0-520-94374-2 (ISBN)
Contributors
Preface
1. Sequence Alignment: Concepts and History
2. Insertion and Deletion Events, Their Molecular Mechanisms, and Their Impact on Sequence Alignments
3. Local versus Global Alignments
4. Computing Multiple Sequence Alignment with Template-Based Methods
5. Sequence Evolution Models for Simultaneous Alignment and Phylogeny Reconstruction
6. Phylogenetic Hypotheses and the Utility of Multiple Sequence Alignment
7. Structural and Evolutionary Considerations for Multiple Sequence Alignment of RNA, and the Challenges for Algorithms That Ignore Them
8. Constructing Alignment Benchmarks
9. Simulation Approaches to Evaluating Alignment Error and Methods for Comparing Alternate Alignments
Contents
10. Robust Inferences from Ambiguous Alignments
11. Strategies for Efficient Exploitation of the Informational Content of Protein Multiple Alignments
References
Index
Erscheint lt. Verlag | 11.3.2009 |
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Sprache | englisch |
Themenwelt | Informatik ► Weitere Themen ► Bioinformatik |
Naturwissenschaften ► Biologie ► Evolution | |
Naturwissenschaften ► Biologie ► Genetik / Molekularbiologie | |
ISBN-10 | 0-520-94374-0 / 0520943740 |
ISBN-13 | 978-0-520-94374-2 / 9780520943742 |
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