Untersuchungen zur genetischen Variabilität porciner Circoviren (PCV2) aus geimpften und ungeimpften Herden

Ziel der vorliegenden Arbeit war es mittels vergleichender Sequenzanalyse, Mutationen innerhalb der für Antigenität und Virusreplikation zuständigen Gene des PCV2-Genoms mit möglicher Assoziation zwischen PCV2-Genotyp, PCV2-Impfstatus und PCV2-Virusmenge in 62 PCV2-Sequenzen aus geimpften und nicht-geimpften Schweinebeständen aus Deutschland zu untersuchen. Als Ausgangsmaterial dienten PCV2-positive Proben, die im Rahmen des Schweinegesundheitsdienstes der Klinik für Wiederkäuer und Schweine, Professur Schweinekrankheiten, der Justus-Liebig-Universität, im Zeitraum 2008 bis 2012 gesammelt wurden. Anhand der beim Bestandsbesuch erstellten Anamnesebögen wurde eine Vorauswahl der Proben nach Herkunft aus geimpften und nicht-geimpften Beständen vorgenommen. 83,9 % der untersuchten 62 PCV2-Sequenzen entsprachen dem Genotyp PCV2b und 14,5 % dem Genotyp PCV2a. Die PCV2-Variante mPCV2b konnte nur ein einziges Mal unter den 62 Sequenzen nachgewiesen werden Die von den Genotypen realisierten PCV2-Erregermengen waren mit 103,6 für PCV2a und 105,5 für PCV2b signifikant (p=0,011) verschieden. Einiges spricht dafür, dass die PCV2-Impfung an der Verdrängung des Genotyps 2a durch 2b zumindest beteiligt sein könnte, da in den Proben der geimpften Bestände bis auf eine Ausnahme nur der Genotyp PCV2b vertreten war. Durch vergleichende Sequenzanalysen konnten Mutationen detektiert und Assoziationen zu PCV2-Virusmenge, PCV2-Genotyp und PCV2-Impfstatus hergestellt werden. Von insgesamt 47 SNPs im ORF2 mit Aminosäuresubstitution wiesen der SNP g.1566C>T (c.169G>A; p.57I>V) und der SNP g.1182G>T (c.553C>A; p.185L>M) eine signifikante Assoziation (p=0,005) zur PCV2-Virusmenge auf. Beide SNPs sind jeweils in immunogenen Bereichen des Kapsidproteins lokalisiert. Des Weiteren bestand eine signifikante Assoziation zwischen dem Aminosäureaustausch des SNP g.1182G>T und den PCV2-Genotypen (p < 0,001) sowie zum Impfstatus der 62 PCV2-Sequenzen (p = 0,03).
In der vorliegenden Arbeit konnte anhand der 62 untersuchten PCV2-Sequenzen ein signifikanter Vorteil der PCV2b gegenüber den PCV2a-Sequenzen nachgewiesen werden. Obwohl die Sequenzen eine hohe Variabilität aufwiesen und somit keine spezifische Sequenz mit den Beobachtungen in Verbindung gebracht werden konnte. Ließ sich eine signifikant Korrelation einiger SNPs zu PCV2-Genotyp, PCV2-Impfstatus und PCV2-Virusmenge nachweisen. Von großer Relevanz hierbei war der im ORF2 lokalisierte SNP an Genomposition 1182 (g.1182G>T), welcher eine Aminosäuresubstitution innerhalb eines immunogenen Epitopes des Kapsidproteins veranlasste. Es wurde ein signifikanter Zusammenhang zwischen PCV2-Impfung und PCV2-Sequenz, PCV2-Genotyp und PCV2-Virusmenge aufgezeigt.