Évaluation des méthodes de détection de la Grapevin virale

La vigne, une culture importante dans de nombreuses régions de Taïwan, est affectée par un certain nombre de maladies. Grapevine yellow speckle viroid-1 (GYSVd-1) et hop stunt viroid (HSVd) sont deux viroïdes connus pour infecter naturellement les vignes. À Taïwan, la culture du raisin est une activité agro-industrielle rémunératrice en raison de la grande popularité des baies de raisin auprès des consommateurs locaux et de la valeur ajoutée des produits transformés. La production annuelle de raisins était de 102 831 tonnes métriques en 2010, et 99,5 % ont été produits dans la ville de Taichung et dans les comtés de Miaoli, Changhua et Nantou, dans le centre de Taïwan. Les séquences génétiques étaient disponibles au National Center for Biotechnology Information (NCBI), et les amorces spécifiques aux gènes pour la RT-PCR ont été conçues à l'aide du logiciel Clustal-W. La méthode a été validée en testant 50 échantillons de vigne de Taïwan ; elle s'est révélée fiable et très sensible et a été mise au point pour la détection simultanée de deux viroïdes de la vigne.