Diversité génétique des streptocoques du groupe viridans

Les streptocoques du groupe viridans (SGV) sont des agents pathogènes responsables d'infections variées telles que les endocardites et les septicémies. Les SGV comportent plus de 26 espèces réunies en cinq sous-groupes : mutans, anginosus, salivarius, sanguinis et mitis. Les méthodes conventionnelles s'avèrent insuffisantes pour l'identification de ces espèces. Le recours à l'utilisation des méthodes moléculaires a ouvert de nouvelles perspectives dans ce domaine. L'étude menée vise à identifier les SGV en utilisant l'hélice 54 du domaine III de l'ARNr 23S et de comparer les relations phylogénétiques basées sur ces séquences avec ceux de la région intergéniques 16S-23S. Pour l'ensemble des 25 souches des SGV étudiées, la région intergénique 16S-23S et l'hélice 54 ont été amplifiées. L'analyse des séquences de cette dernière a permis d'identifier toutes les souches étudiées à un niveau d'espèces, à l'exception de celles appartenant au sous-groupe mitis. Ceci prouve que le séquençage de l'hélice 54 du domaine III de l'ARNr 23S serait une méthode fiable pour l'identification, à un niveau d'espèce, des souches appartenant aux sous-groupes anginosus, mutans et sanguinis